Bienvenue sur la page personnelle de Simona Grusea
Ressources pour les étudiants.
Actuellement je suis Maître de Conférences à l'Institut National des Sciences Appliquées (INSA) de Toulouse, au sein du Département
Génie Mathématique et Modélisation.
Côté recherche, j'appartiens à l'Equipe Statistique et Probabilités de l'Institut Mathématique de Toulouse (IMT).
Contact
Département GMM, INSA de Toulouse
135, Avenue de Rangueil - 31077 Toulouse Cedex 4, France.
Tél.: 05 61 55 93 46.
Pour m'envoyer un email: simona.grusea [at] insa-toulouse.fr
ou cliquer ici: Simona Grusea
Domaines de recherche
J'ai soutenu ma thèse de doctorat en décembre 2008, à l'Université de Provence, sous la direction d'Etienne PARDOUX et Pierre PONTAROTTI.
Le titre de ma thèse : ``Applications du calcul des probabilités à la recherche de régions génomiques conservées''.
Vous pouvez trouvez un exemplaire ici.
Parmi mes centres d'intérêt :
- les probabilités appliquées à la comparaison des génomes;
- l'étude des distances de réarrangement entre génomes (permutations non-signées et signées) et leur distribution pour une permutation aléatoire;
- la combinatoire énumerative et les probabilités discrètes;
- la génétique des populations et les processus de coalescence ;
- étude de score pour des séquences markoviennes.
Publications
- C.-E. Rabier and S. Grusea (2021), ``Prediction in high dimensional linear models and application to genomic selection under imperfect linkage disequilibrium'', Journal of the Royal Statistical Society: Series C. In print.
- S. Grusea and A. Labarre (2021), ``Central limit theorem for the prefix echange distribution under Ewens sampling formula'', Discrete Mathematics 344, Issue 2, 112206. (https://doi.org/10.1016/j.disc.2020.112206)
- S. Grusea and S. Mercier (2020), ``Improvements on the distribution of maximal segmental scores in a Markovian sequence’’, Journal of Applied Probability 57, pp. 29-52.
- S. Grusea, W. Rodriguez, D. Pinchon, L. Chikhi, S. Boitard and O. Mazet (2019), ``Coalescence times for three genes provide sufficient information to distinguish population structure from population size changes'', Journal of Mathematical Biology 78, pp. 189-224.
- C.-E. Rabier, B. Mangin and S. Grusea (2019), ``On the accuracy in high dimensional linear models and its application to genomic selection'', Scandinavian Journal of Statistics 46, pp. 289-313.
- W. Rodriguez, O. Mazet, S. Grusea, A. Arredondo, J.M. Corujo, S. Boitard and L. Chikhi (2018), ``The IICR and the non-stationary coalescent: demographic inference with arbitrary changes in population structure’’, Heredity 121, pp. 663–-678.
- L. Chikhi, W. Rodriguez, S. Grusea, P. Santos, S. Boitard and O. Mazet (2018), ``The IICR (inverse instantaneous coalescence rate) as a summary of genomic diversity: insights into demographic inference and model choice'', Heredity 120, pp. 13-24.
- S. Grusea and A. Labarre (2016), ``Asymptotic normality and combinatorial aspects of the prefix exchange distance distribution'', Advances in Applied Mathematics 78, pp. 94-113.
- O. Mazet, W. Rodriguez, S. Grusea, S. Boitard and L. Chikhi (2016), ``On the importance of being structured: instantaneous coalescence rates and a re-evaluation of human evolution", Heredity 116(4), pp. 362–371.
- J. Suurväli, L. Jouneau, D. Thépot, S. Grusea, P. Pontarotti, L. Du Pasquier, S. Rüütel Boudinot and P. Boudinot (2014), ``The proto-MHC of placozoans, a region specialized in cellular stress and ubiquitination/proteasome pathways", Journal of Immunology 193(6), pp. 2891--2901.
- S. Grusea and A. Labarre (2013), ``The distribution of cycles in breakpoint graphs of signed permutations'', Discrete Applied Mathematics 161, pp. 1448--1466.
- S. Grusea, E. Pardoux, O. Chabrol and P. Pontarotti (2011), ``Compound Poisson approximation and testing for gene clusters with multigene families'', Journal of Computational Biology 18(4), pp. 579-594.
- S. Grusea (2011), ``On the distribution of the number of cycles in the breakpoint graph of a random signed permutation'', IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics 8(5), pp. 1411-1416.
- S. Grusea (2010), ``Measures for the exceptionality of gene order in conserved genomic regions'', Advances in Applied Mathematics 45(3), pp. 359-372.
- I. Zucchetti, R. de Santis, S. Grusea, P. Pontarotti and L. du Pasquier (2009), ``Origin and evolution of the vertebrate leukocyte receptors: the lesson from tunicates'', Immunogenetics 61(6), pp. 463-481.
- V. Lopez Rascol, A. Levasseur, O. Chabrol, S. Grusea, P. Gouret, E. Danchin and P. Pontarotti (2009), ``CASSIOPE: An expert system for conserved regions searches'',
BMC Bioinformatics 10:284.
Autres mémoires :